Web of Science核心合集（简称WOS核心合集）仅收录了全球优秀期刊、会议或图书等类型的文献。
在系统默认的WOS核心合集检索界面上，点击“更多设置”可见引文索引选择项（见图1），即Science Citation lndex Expanded （科学引文索引扩展版，简称SCIE）、Social Science Citation Index（社会科学引文索引，简称SSCI）、Conference Proceedings Citation Index -Science（此引文索引涵盖了所有科技领域的会议录文献，简称CPCI-S）、以及两个化学索引选择项，即CurrentChemical Reactions和Index Chemicus。实际上，WOS核心合集还有Art & Humanities CitationIndex（艺术和人文学科引文索引，简称A&HCI）、 Conference Proceedings Citation Index - Social Sciences & Humanities（此引文索引涵盖了社会科学、艺术及人文科学的所有领域的会议录文献，简称CPCI-SSH）。其中，SCIE收录高水平自然科学、工程技术类期刊，SSCI收录高水平社会科学领域期刊，A&HC收录高水平艺术和人文学科领域期刊，SCPCI-S收录高水平科技类会议文献，CPCI-SSH收录社会科学类高水平会议文献，这些高水平学术论文索引可以根据需要单独购买使用权，因此不同机构用户的WOS核心合集中涉及的索引库不尽相同。但需要注意的是：虽然化学索引中的两个子库，提供了化合物结构和反应检索，但对于需要使用化合物结构和反应检索的检索课题，建议使用SciFinder数据库。
图1：Web of Science核心合集
WOS核心合集提供多种检索途径：基本检索、被引参考文献检索及高级检索，点击右边的“更多内容”，可以显示“作者检索”及“化学结构检索”。
在基本检索界面上，点击“添加另一字段”，可增加一条文本框，与前面的文本框构成逻辑组配关系，多次点击该按钮，可增加多条文本框。
Web of Science检索规则如下：
（1）逻辑算符：AND、OR、NOT;
（2）词组：""，检索词之间用空格符分隔;
（3）NEAR：邻近算符，但不可用于“出版年”字段;（4） SAME：仅用于地址字段;
（5）截词：*表示此处可有零或任意多个字符，如： pharmac*可检出pharmacy ,harmacology，pharmaceutics等; $表示此处可有0或1个字符;*、$不能用于字符的最前端，且到少应在3个字符之后;
（6）主题检索字段，实际检索题名-关键词-摘要三个字段;
（7）如需设定作者单位检索条件，请使用“地址”检索字段
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